Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIP4Q15650 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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