Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TAF11Q15544 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TAF11Q15544 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TAF11Q15544 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TAF11Q15544 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TAF11Q15544 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TAF11Q15544 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
TAF11Q15544 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TAF11Q15544 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TAF11Q15544 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms