Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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