Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms