Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 NR2C2AP-201ENST00000331552 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 S100A7A-202ENST00000368728 440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 ZNF684-201ENST00000372696 1009 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 SPTLC1P3-201ENST00000403408 259 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 INMT-202ENST00000409539 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 AC090696.1-201ENST00000419100 418 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 NR2C2AP-202ENST00000420605 859 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 RN7SL794P-201ENST00000469816 280 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 AF186996.6-201ENST00000485294 149 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 ALDOAP1-201ENST00000491506 1078 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 DDIAS-204ENST00000525388 961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 THEG-204ENST00000530711 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 CSH2-207ENST00000613718 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 AC093495.1-215ENST00000626655 821 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 WFDC2-203ENST00000342873 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 OR2W3-201ENST00000360358 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 C10orf90-207ENST00000480379 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 TMEM154-202ENST00000504064 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 BACE1-207ENST00000510630 1236 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 AC104117.4-201ENST00000521486 847 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 CETN3-205ENST00000522842 664 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 CSRP2-207ENST00000552330 910 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 AC016590.1-201ENST00000588763 420 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 LINC01002-223ENST00000633179 407 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
R3HDM1Q15032 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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