Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms