Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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