Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 IQUB-202ENST00000466202 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 VAMP1-201ENST00000361716 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 ANAPC7-203ENST00000455511 3045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 MDGA1-207ENST00000505425 3021 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 TMPRSS7-201ENST00000419127 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 CSTF2-203ENST00000415585 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 TEX35-203ENST00000367641 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 ATG10-201ENST00000282185 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 AL391845.2-201ENST00000443930 1954 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 PPP1R11-204ENST00000376769 1689 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 ARNTL-202ENST00000401424 2788 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 GADL1-201ENST00000282538 3759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 KRT78-202ENST00000359499 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 GRK7-201ENST00000264952 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 GUCY1B3-202ENST00000502959 2255 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 KIAA1324-210ENST00000529753 2903 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 AL162391.1-201ENST00000419853 2102 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 PAX6-207ENST00000379129 2614 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 MYO1D-206ENST00000579584 3500 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 KDM6A-214ENST00000621147 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 VASH2-203ENST00000366965 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 NLRP2-201ENST00000263437 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 DENND1C-201ENST00000381480 2816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 ESRRB-204ENST00000509242 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 CST3-203ENST00000398411 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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