Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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CLN3Q13286 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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CLN3Q13286 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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CLN3Q13286 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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CLN3Q13286 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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CLN3Q13286 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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CLN3Q13286 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 Metazoa_SRP.12-201ENST00000553249 268 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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