Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP1B1Q10567 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms