Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC8Q09428 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms