Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSC1Q08554 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms