Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms