Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms