Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms