Protein–RNA interactions for Protein: Q01543

FLI1, Friend leukemia integration 1 transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLI1Q01543 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 DYSF-208ENST00000410020 6657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 KLK2-202ENST00000358049 2847 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 SLC11A1-201ENST00000233202 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 AGAP3-205ENST00000463381 2730 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 HSPA12A-201ENST00000369209 5722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 CLPX-201ENST00000300107 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 STK11IP-204ENST00000456909 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 PSMD2-205ENST00000435761 2574 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 PLOD3-201ENST00000223127 2920 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 AC237221.1-202ENST00000563054 2947 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 PPP2R1A-205ENST00000462990 2730 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 GRAMD1B-215ENST00000638086 2665 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 SLC12A6-205ENST00000458406 4425 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 SPCS2-209ENST00000610881 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 PARN-203ENST00000437198 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 CEACAM20-203ENST00000614924 1809 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 PAX6-207ENST00000379129 2614 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 MATR3-227ENST00000618441 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 NBN-203ENST00000409330 4523 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FLI1Q01543 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms