Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms