Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM3AP98173 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms