Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 ATL2-204ENST00000406122 2864 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms