Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VBP1P61758 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VBP1P61758 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VBP1P61758 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VBP1P61758 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VBP1P61758 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VBP1P61758 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VBP1P61758 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VBP1P61758 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VBP1P61758 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VBP1P61758 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VBP1P61758 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
VBP1P61758 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VBP1P61758 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VBP1P61758 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VBP1P61758 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VBP1P61758 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VBP1P61758 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VBP1P61758 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VBP1P61758 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VBP1P61758 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VBP1P61758 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VBP1P61758 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VBP1P61758 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VBP1P61758 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VBP1P61758 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VBP1P61758 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VBP1P61758 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VBP1P61758 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VBP1P61758 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VBP1P61758 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VBP1P61758 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VBP1P61758 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VBP1P61758 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VBP1P61758 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VBP1P61758 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
VBP1P61758 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VBP1P61758 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VBP1P61758 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VBP1P61758 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VBP1P61758 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VBP1P61758 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VBP1P61758 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VBP1P61758 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VBP1P61758 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VBP1P61758 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VBP1P61758 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VBP1P61758 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VBP1P61758 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VBP1P61758 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
VBP1P61758 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VBP1P61758 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
VBP1P61758 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VBP1P61758 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VBP1P61758 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VBP1P61758 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VBP1P61758 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VBP1P61758 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VBP1P61758 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
VBP1P61758 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VBP1P61758 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
VBP1P61758 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VBP1P61758 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VBP1P61758 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VBP1P61758 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VBP1P61758 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
VBP1P61758 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
VBP1P61758 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VBP1P61758 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VBP1P61758 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VBP1P61758 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VBP1P61758 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VBP1P61758 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VBP1P61758 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VBP1P61758 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
VBP1P61758 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VBP1P61758 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VBP1P61758 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VBP1P61758 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VBP1P61758 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
VBP1P61758 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
VBP1P61758 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VBP1P61758 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VBP1P61758 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VBP1P61758 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
VBP1P61758 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VBP1P61758 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VBP1P61758 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
VBP1P61758 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
VBP1P61758 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VBP1P61758 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VBP1P61758 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VBP1P61758 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VBP1P61758 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
VBP1P61758 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VBP1P61758 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VBP1P61758 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VBP1P61758 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
VBP1P61758 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VBP1P61758 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms