Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ACTBP60709 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ACTBP60709 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ACTBP60709 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ACTBP60709 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ACTBP60709 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ACTBP60709 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ACTBP60709 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ACTBP60709 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ACTBP60709 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ACTBP60709 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ACTBP60709 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ACTBP60709 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ACTBP60709 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ACTBP60709 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ACTBP60709 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ACTBP60709 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ACTBP60709 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ACTBP60709 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ACTBP60709 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ACTBP60709 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ACTBP60709 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ACTBP60709 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ACTBP60709 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ACTBP60709 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ACTBP60709 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ACTBP60709 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ACTBP60709 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ACTBP60709 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ACTBP60709 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ACTBP60709 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ACTBP60709 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ACTBP60709 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ACTBP60709 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ACTBP60709 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ACTBP60709 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ACTBP60709 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ACTBP60709 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ACTBP60709 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ACTBP60709 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ACTBP60709 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ACTBP60709 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ACTBP60709 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ACTBP60709 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ACTBP60709 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ACTBP60709 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ACTBP60709 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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ACTBP60709 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ACTBP60709 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ACTBP60709 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ACTBP60709 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ACTBP60709 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ACTBP60709 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ACTBP60709 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ACTBP60709 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ACTBP60709 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ACTBP60709 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ACTBP60709 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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ACTBP60709 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ACTBP60709 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ACTBP60709 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ACTBP60709 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ACTBP60709 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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ACTBP60709 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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ACTBP60709 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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ACTBP60709 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ACTBP60709 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
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ACTBP60709 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ACTBP60709 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ACTBP60709 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ACTBP60709 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ACTBP60709 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ACTBP60709 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ACTBP60709 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ACTBP60709 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ACTBP60709 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ACTBP60709 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ACTBP60709 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ACTBP60709 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ACTBP60709 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ACTBP60709 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ACTBP60709 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ACTBP60709 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ACTBP60709 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ACTBP60709 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ACTBP60709 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ACTBP60709 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ACTBP60709 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ACTBP60709 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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