Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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