Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSCP56915 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSCP56915 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSCP56915 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSCP56915 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSCP56915 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSCP56915 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSCP56915 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GSCP56915 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSCP56915 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSCP56915 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSCP56915 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSCP56915 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSCP56915 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GSCP56915 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSCP56915 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSCP56915 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSCP56915 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSCP56915 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSCP56915 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSCP56915 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GSCP56915 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GSCP56915 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSCP56915 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GSCP56915 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GSCP56915 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSCP56915 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSCP56915 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSCP56915 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSCP56915 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSCP56915 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSCP56915 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSCP56915 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSCP56915 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSCP56915 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSCP56915 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSCP56915 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSCP56915 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSCP56915 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSCP56915 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSCP56915 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSCP56915 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSCP56915 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSCP56915 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSCP56915 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSCP56915 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GSCP56915 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSCP56915 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSCP56915 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSCP56915 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSCP56915 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSCP56915 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSCP56915 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSCP56915 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSCP56915 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSCP56915 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSCP56915 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSCP56915 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSCP56915 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSCP56915 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSCP56915 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSCP56915 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GSCP56915 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSCP56915 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSCP56915 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSCP56915 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSCP56915 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSCP56915 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GSCP56915 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSCP56915 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSCP56915 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSCP56915 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSCP56915 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GSCP56915 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSCP56915 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSCP56915 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSCP56915 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GSCP56915 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GSCP56915 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSCP56915 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GSCP56915 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSCP56915 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSCP56915 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSCP56915 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSCP56915 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSCP56915 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSCP56915 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSCP56915 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSCP56915 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSCP56915 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSCP56915 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSCP56915 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSCP56915 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSCP56915 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSCP56915 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSCP56915 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSCP56915 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSCP56915 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSCP56915 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSCP56915 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms