Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms