Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRE11P49959 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRE11P49959 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRE11P49959 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRE11P49959 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRE11P49959 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRE11P49959 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRE11P49959 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MRE11P49959 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRE11P49959 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRE11P49959 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MRE11P49959 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MRE11P49959 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRE11P49959 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRE11P49959 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRE11P49959 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRE11P49959 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRE11P49959 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRE11P49959 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRE11P49959 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRE11P49959 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRE11P49959 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRE11P49959 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MRE11P49959 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRE11P49959 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRE11P49959 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MRE11P49959 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MRE11P49959 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MRE11P49959 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MRE11P49959 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MRE11P49959 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRE11P49959 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRE11P49959 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRE11P49959 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRE11P49959 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRE11P49959 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRE11P49959 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRE11P49959 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRE11P49959 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRE11P49959 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRE11P49959 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRE11P49959 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRE11P49959 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRE11P49959 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRE11P49959 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRE11P49959 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRE11P49959 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRE11P49959 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRE11P49959 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRE11P49959 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRE11P49959 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRE11P49959 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRE11P49959 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRE11P49959 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRE11P49959 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRE11P49959 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MRE11P49959 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRE11P49959 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRE11P49959 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRE11P49959 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRE11P49959 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRE11P49959 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRE11P49959 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRE11P49959 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRE11P49959 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRE11P49959 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRE11P49959 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRE11P49959 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRE11P49959 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRE11P49959 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRE11P49959 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRE11P49959 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRE11P49959 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRE11P49959 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRE11P49959 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRE11P49959 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRE11P49959 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRE11P49959 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRE11P49959 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRE11P49959 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRE11P49959 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRE11P49959 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MRE11P49959 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRE11P49959 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRE11P49959 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRE11P49959 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MRE11P49959 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRE11P49959 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRE11P49959 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRE11P49959 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRE11P49959 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRE11P49959 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MRE11P49959 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRE11P49959 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRE11P49959 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRE11P49959 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRE11P49959 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRE11P49959 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRE11P49959 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRE11P49959 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms