Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF6P49848 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF6P49848 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF6P49848 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF6P49848 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF6P49848 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF6P49848 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF6P49848 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF6P49848 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF6P49848 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF6P49848 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF6P49848 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF6P49848 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF6P49848 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF6P49848 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF6P49848 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF6P49848 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF6P49848 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF6P49848 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF6P49848 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF6P49848 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF6P49848 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF6P49848 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF6P49848 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF6P49848 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF6P49848 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF6P49848 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF6P49848 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF6P49848 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF6P49848 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF6P49848 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF6P49848 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF6P49848 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF6P49848 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF6P49848 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF6P49848 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF6P49848 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF6P49848 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF6P49848 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TAF6P49848 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TAF6P49848 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TAF6P49848 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TAF6P49848 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TAF6P49848 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TAF6P49848 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TAF6P49848 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TAF6P49848 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TAF6P49848 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TAF6P49848 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TAF6P49848 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TAF6P49848 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TAF6P49848 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TAF6P49848 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TAF6P49848 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TAF6P49848 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TAF6P49848 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF6P49848 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF6P49848 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF6P49848 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF6P49848 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF6P49848 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF6P49848 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF6P49848 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF6P49848 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF6P49848 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF6P49848 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF6P49848 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF6P49848 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF6P49848 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF6P49848 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF6P49848 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF6P49848 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF6P49848 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF6P49848 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF6P49848 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF6P49848 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF6P49848 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF6P49848 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF6P49848 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF6P49848 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF6P49848 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF6P49848 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF6P49848 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF6P49848 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF6P49848 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF6P49848 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF6P49848 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF6P49848 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF6P49848 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF6P49848 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF6P49848 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF6P49848 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF6P49848 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF6P49848 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF6P49848 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF6P49848 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF6P49848 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF6P49848 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF6P49848 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF6P49848 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms