Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP4P49662 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP4P49662 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP4P49662 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP4P49662 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP4P49662 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP4P49662 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP4P49662 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP4P49662 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP4P49662 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP4P49662 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP4P49662 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP4P49662 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP4P49662 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP4P49662 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP4P49662 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP4P49662 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP4P49662 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP4P49662 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP4P49662 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP4P49662 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP4P49662 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP4P49662 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP4P49662 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
CASP4P49662 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP4P49662 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP4P49662 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP4P49662 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP4P49662 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP4P49662 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP4P49662 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP4P49662 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP4P49662 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP4P49662 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP4P49662 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP4P49662 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP4P49662 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP4P49662 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP4P49662 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP4P49662 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP4P49662 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP4P49662 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP4P49662 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP4P49662 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP4P49662 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP4P49662 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP4P49662 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP4P49662 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP4P49662 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP4P49662 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP4P49662 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP4P49662 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP4P49662 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP4P49662 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP4P49662 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP4P49662 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP4P49662 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP4P49662 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP4P49662 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP4P49662 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP4P49662 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP4P49662 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP4P49662 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP4P49662 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP4P49662 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP4P49662 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP4P49662 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP4P49662 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP4P49662 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP4P49662 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP4P49662 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP4P49662 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP4P49662 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP4P49662 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP4P49662 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP4P49662 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP4P49662 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP4P49662 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP4P49662 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP4P49662 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP4P49662 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP4P49662 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP4P49662 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP4P49662 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP4P49662 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP4P49662 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP4P49662 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP4P49662 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP4P49662 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP4P49662 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP4P49662 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP4P49662 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP4P49662 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP4P49662 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP4P49662 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP4P49662 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP4P49662 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP4P49662 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP4P49662 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP4P49662 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.6 ms