Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTAP49354 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTAP49354 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTAP49354 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTAP49354 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTAP49354 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTAP49354 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTAP49354 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTAP49354 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTAP49354 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTAP49354 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTAP49354 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTAP49354 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTAP49354 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTAP49354 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTAP49354 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTAP49354 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTAP49354 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTAP49354 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTAP49354 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTAP49354 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTAP49354 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTAP49354 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTAP49354 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTAP49354 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTAP49354 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTAP49354 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTAP49354 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTAP49354 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTAP49354 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTAP49354 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTAP49354 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTAP49354 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTAP49354 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTAP49354 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTAP49354 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTAP49354 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTAP49354 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTAP49354 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTAP49354 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTAP49354 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTAP49354 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTAP49354 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTAP49354 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTAP49354 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTAP49354 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTAP49354 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTAP49354 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTAP49354 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTAP49354 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTAP49354 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTAP49354 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTAP49354 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTAP49354 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTAP49354 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTAP49354 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTAP49354 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTAP49354 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTAP49354 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTAP49354 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTAP49354 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTAP49354 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTAP49354 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTAP49354 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTAP49354 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTAP49354 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTAP49354 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTAP49354 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTAP49354 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTAP49354 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTAP49354 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTAP49354 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTAP49354 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTAP49354 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTAP49354 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTAP49354 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTAP49354 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTAP49354 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTAP49354 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTAP49354 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTAP49354 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTAP49354 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTAP49354 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTAP49354 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTAP49354 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTAP49354 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTAP49354 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTAP49354 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTAP49354 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTAP49354 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTAP49354 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTAP49354 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTAP49354 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTAP49354 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTAP49354 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTAP49354 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTAP49354 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTAP49354 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTAP49354 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FNTAP49354 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms