Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ME1P48163 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ME1P48163 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ME1P48163 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ME1P48163 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ME1P48163 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ME1P48163 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ME1P48163 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ME1P48163 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ME1P48163 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ME1P48163 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ME1P48163 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ME1P48163 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ME1P48163 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ME1P48163 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ME1P48163 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ME1P48163 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ME1P48163 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ME1P48163 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ME1P48163 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ME1P48163 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ME1P48163 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ME1P48163 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ME1P48163 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ME1P48163 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ME1P48163 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ME1P48163 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ME1P48163 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ME1P48163 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ME1P48163 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ME1P48163 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ME1P48163 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ME1P48163 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ME1P48163 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ME1P48163 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ME1P48163 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ME1P48163 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ME1P48163 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ME1P48163 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ME1P48163 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ME1P48163 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ME1P48163 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ME1P48163 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ME1P48163 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ME1P48163 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ME1P48163 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ME1P48163 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ME1P48163 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ME1P48163 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ME1P48163 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ME1P48163 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ME1P48163 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ME1P48163 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ME1P48163 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ME1P48163 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ME1P48163 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ME1P48163 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ME1P48163 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ME1P48163 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ME1P48163 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ME1P48163 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ME1P48163 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ME1P48163 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ME1P48163 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ME1P48163 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ME1P48163 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ME1P48163 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ME1P48163 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ME1P48163 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ME1P48163 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ME1P48163 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ME1P48163 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ME1P48163 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ME1P48163 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ME1P48163 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ME1P48163 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ME1P48163 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ME1P48163 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ME1P48163 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ME1P48163 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ME1P48163 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ME1P48163 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ME1P48163 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ME1P48163 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ME1P48163 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ME1P48163 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ME1P48163 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ME1P48163 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ME1P48163 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ME1P48163 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ME1P48163 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ME1P48163 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ME1P48163 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ME1P48163 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ME1P48163 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ME1P48163 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ME1P48163 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ME1P48163 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ME1P48163 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ME1P48163 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms