Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRCC3P46736 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms