Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 FXYD2-202ENST00000292079 571 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 SFTPA2-202ENST00000372327 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 KRTAP10-12-201ENST00000400365 873 ntAPPRIS P2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 CIDEC-204ENST00000430427 877 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 AC109830.1-203ENST00000506638 467 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 HNRNPA1P72-201ENST00000529511 967 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 PLXNA4-202ENST00000359827 13786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 U3.41-201ENST00000408711 219 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 AC004771.1-201ENST00000438266 583 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 AL139317.2-201ENST00000556998 158 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 FXYD3-210ENST00000604621 548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 AL121992.3-201ENST00000606186 346 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 AC022296.3-201ENST00000608823 403 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 AC106782.5-201ENST00000616011 337 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRXP46100 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 SUGT1-202ENST00000343788 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 GAPDH-202ENST00000396856 1266 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 IMMP1L-215ENST00000534812 612 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 GABARAPL1-219ENST00000629504 379 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 MCRS1-203ENST00000546244 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms