Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACADSBP45954 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms