Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms