Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GGCXP38435 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GGCXP38435 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GGCXP38435 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GGCXP38435 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GGCXP38435 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GGCXP38435 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GGCXP38435 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GGCXP38435 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GGCXP38435 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GGCXP38435 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GGCXP38435 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GGCXP38435 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GGCXP38435 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GGCXP38435 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GGCXP38435 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GGCXP38435 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GGCXP38435 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GGCXP38435 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GGCXP38435 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GGCXP38435 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GGCXP38435 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GGCXP38435 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GGCXP38435 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GGCXP38435 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GGCXP38435 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GGCXP38435 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GGCXP38435 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GGCXP38435 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GGCXP38435 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GGCXP38435 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GGCXP38435 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GGCXP38435 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GGCXP38435 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GGCXP38435 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GGCXP38435 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GGCXP38435 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GGCXP38435 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GGCXP38435 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GGCXP38435 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GGCXP38435 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GGCXP38435 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GGCXP38435 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GGCXP38435 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GGCXP38435 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GGCXP38435 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GGCXP38435 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GGCXP38435 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GGCXP38435 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GGCXP38435 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GGCXP38435 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GGCXP38435 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GGCXP38435 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GGCXP38435 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GGCXP38435 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GGCXP38435 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GGCXP38435 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GGCXP38435 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GGCXP38435 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GGCXP38435 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GGCXP38435 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GGCXP38435 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GGCXP38435 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GGCXP38435 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GGCXP38435 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GGCXP38435 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GGCXP38435 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GGCXP38435 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GGCXP38435 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GGCXP38435 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GGCXP38435 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GGCXP38435 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GGCXP38435 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GGCXP38435 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GGCXP38435 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GGCXP38435 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GGCXP38435 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GGCXP38435 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GGCXP38435 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GGCXP38435 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GGCXP38435 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GGCXP38435 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GGCXP38435 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GGCXP38435 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GGCXP38435 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GGCXP38435 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GGCXP38435 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GGCXP38435 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GGCXP38435 OR13I1P-201ENST00000609811 1264 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GGCXP38435 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GGCXP38435 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GGCXP38435 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GGCXP38435 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GGCXP38435 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GGCXP38435 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GGCXP38435 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GGCXP38435 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GGCXP38435 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GGCXP38435 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GGCXP38435 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms