Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 KIF3A-208ENST00000618515 3333 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD40LGP29965 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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