Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

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Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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