Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCSK1P29120 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms