Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLD1P28340 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLD1P28340 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLD1P28340 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
POLD1P28340 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
POLD1P28340 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
POLD1P28340 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLD1P28340 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLD1P28340 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLD1P28340 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLD1P28340 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
POLD1P28340 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLD1P28340 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
POLD1P28340 AC079779.4-201ENST00000619113 548 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLD1P28340 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLD1P28340 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLD1P28340 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLD1P28340 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLD1P28340 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLD1P28340 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLD1P28340 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLD1P28340 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLD1P28340 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLD1P28340 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLD1P28340 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLD1P28340 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
POLD1P28340 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLD1P28340 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLD1P28340 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLD1P28340 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLD1P28340 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
POLD1P28340 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLD1P28340 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLD1P28340 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
POLD1P28340 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLD1P28340 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
POLD1P28340 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLD1P28340 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLD1P28340 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLD1P28340 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLD1P28340 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLD1P28340 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLD1P28340 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLD1P28340 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLD1P28340 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLD1P28340 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLD1P28340 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLD1P28340 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLD1P28340 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLD1P28340 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLD1P28340 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLD1P28340 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLD1P28340 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLD1P28340 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLD1P28340 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
POLD1P28340 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLD1P28340 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLD1P28340 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLD1P28340 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLD1P28340 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLD1P28340 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLD1P28340 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLD1P28340 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLD1P28340 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLD1P28340 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLD1P28340 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLD1P28340 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLD1P28340 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLD1P28340 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLD1P28340 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLD1P28340 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLD1P28340 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLD1P28340 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLD1P28340 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLD1P28340 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLD1P28340 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
POLD1P28340 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
POLD1P28340 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLD1P28340 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLD1P28340 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLD1P28340 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLD1P28340 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLD1P28340 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLD1P28340 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLD1P28340 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLD1P28340 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLD1P28340 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLD1P28340 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLD1P28340 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
POLD1P28340 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLD1P28340 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLD1P28340 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLD1P28340 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLD1P28340 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
POLD1P28340 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
POLD1P28340 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLD1P28340 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLD1P28340 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
POLD1P28340 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
POLD1P28340 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms