Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms