Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPREP23469 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPREP23469 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPREP23469 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPREP23469 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPREP23469 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPREP23469 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPREP23469 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPREP23469 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPREP23469 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPREP23469 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPREP23469 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPREP23469 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPREP23469 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPREP23469 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPREP23469 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPREP23469 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPREP23469 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPREP23469 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPREP23469 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPREP23469 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPREP23469 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPREP23469 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPREP23469 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPREP23469 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPREP23469 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPREP23469 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPREP23469 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPREP23469 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPREP23469 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPREP23469 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPREP23469 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPREP23469 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPREP23469 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPREP23469 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPREP23469 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPREP23469 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPREP23469 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPREP23469 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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PTPREP23469 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPREP23469 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPREP23469 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPREP23469 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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PTPREP23469 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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PTPREP23469 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPREP23469 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPREP23469 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPREP23469 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPREP23469 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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PTPREP23469 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPREP23469 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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PTPREP23469 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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PTPREP23469 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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PTPREP23469 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPREP23469 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPREP23469 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPREP23469 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPREP23469 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPREP23469 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPREP23469 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPREP23469 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPREP23469 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPREP23469 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPREP23469 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPREP23469 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPREP23469 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPREP23469 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPREP23469 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPREP23469 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPREP23469 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPREP23469 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPREP23469 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPREP23469 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPREP23469 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPREP23469 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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