Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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PTPRDP23468 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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PTPRDP23468 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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