Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT1P21579 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT1P21579 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT1P21579 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT1P21579 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT1P21579 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT1P21579 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT1P21579 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT1P21579 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT1P21579 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT1P21579 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT1P21579 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT1P21579 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT1P21579 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT1P21579 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT1P21579 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT1P21579 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT1P21579 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT1P21579 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT1P21579 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT1P21579 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT1P21579 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT1P21579 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT1P21579 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT1P21579 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT1P21579 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT1P21579 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT1P21579 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT1P21579 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT1P21579 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT1P21579 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT1P21579 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT1P21579 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT1P21579 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT1P21579 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT1P21579 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT1P21579 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT1P21579 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT1P21579 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT1P21579 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT1P21579 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT1P21579 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT1P21579 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT1P21579 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT1P21579 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT1P21579 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT1P21579 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT1P21579 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT1P21579 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT1P21579 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT1P21579 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT1P21579 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT1P21579 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT1P21579 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT1P21579 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT1P21579 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYT1P21579 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYT1P21579 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYT1P21579 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYT1P21579 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYT1P21579 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SYT1P21579 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYT1P21579 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYT1P21579 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYT1P21579 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYT1P21579 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYT1P21579 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYT1P21579 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYT1P21579 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYT1P21579 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYT1P21579 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SYT1P21579 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYT1P21579 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYT1P21579 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYT1P21579 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYT1P21579 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYT1P21579 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYT1P21579 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYT1P21579 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYT1P21579 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYT1P21579 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYT1P21579 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYT1P21579 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYT1P21579 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYT1P21579 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYT1P21579 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SYT1P21579 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYT1P21579 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYT1P21579 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYT1P21579 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYT1P21579 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYT1P21579 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYT1P21579 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYT1P21579 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYT1P21579 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYT1P21579 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYT1P21579 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYT1P21579 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYT1P21579 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYT1P21579 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms