Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM21P19474 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms