Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN1P18031 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms