Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms