Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMDP11532 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
DMDP11532 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMDP11532 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMDP11532 RPL10P8-201ENST00000522888 313 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
DMDP11532 AC008750.2-201ENST00000526996 627 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMDP11532 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
DMDP11532 CSRP2-207ENST00000552330 910 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMDP11532 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMDP11532 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
DMDP11532 NR1I2-206ENST00000638727 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMDP11532 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMDP11532 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMDP11532 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMDP11532 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMDP11532 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMDP11532 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMDP11532 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMDP11532 AL133351.2-201ENST00000437718 484 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMDP11532 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
DMDP11532 C10orf90-207ENST00000480379 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMDP11532 EFNA5-204ENST00000509503 637 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMDP11532 TBX5-AS1-202ENST00000531024 766 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMDP11532 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMDP11532 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMDP11532 UBA52-214ENST00000599595 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMDP11532 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
DMDP11532 AC093495.1-215ENST00000626655 821 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMDP11532 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMDP11532 AL031590.1-202ENST00000641466 1737 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
DMDP11532 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMDP11532 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMDP11532 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMDP11532 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMDP11532 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMDP11532 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMDP11532 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMDP11532 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMDP11532 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMDP11532 FTH1P18-201ENST00000412071 549 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
DMDP11532 DMKN-211ENST00000436012 848 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMDP11532 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMDP11532 ZNF677-210ENST00000601413 706 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMDP11532 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMDP11532 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMDP11532 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMDP11532 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMDP11532 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMDP11532 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMDP11532 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMDP11532 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMDP11532 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMDP11532 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMDP11532 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMDP11532 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMDP11532 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMDP11532 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMDP11532 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMDP11532 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
DMDP11532 AC004771.1-201ENST00000438266 583 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMDP11532 AL450346.2-201ENST00000495602 1024 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
DMDP11532 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
DMDP11532 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMDP11532 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMDP11532 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMDP11532 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMDP11532 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMDP11532 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
DMDP11532 GIMAP6-202ENST00000493969 876 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DMDP11532 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DMDP11532 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
DMDP11532 PLA2G4C-AS1-203ENST00000601950 454 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DMDP11532 AC127002.1-201ENST00000619123 455 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
DMDP11532 KCNQ1OT1_1.1-201ENST00000622358 464 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
DMDP11532 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DMDP11532 CEBPZOS-203ENST00000397226 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DMDP11532 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DMDP11532 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DMDP11532 ADCK1-201ENST00000238561 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DMDP11532 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
DMDP11532 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DMDP11532 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DMDP11532 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DMDP11532 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DMDP11532 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DMDP11532 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DMDP11532 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DMDP11532 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DMDP11532 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
DMDP11532 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DMDP11532 AKIP1-203ENST00000309377 1327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DMDP11532 SMIM4-201ENST00000307106 274 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DMDP11532 S100A7A-202ENST00000368728 440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DMDP11532 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DMDP11532 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
DMDP11532 BCAS4-206ENST00000609336 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DMDP11532 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DMDP11532 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DMDP11532 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DMDP11532 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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