Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CD28P10747 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CD28P10747 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
CD28P10747 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
CD28P10747 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
CD28P10747 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CD28P10747 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
CD28P10747 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CD28P10747 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
CD28P10747 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CD28P10747 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CD28P10747 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
CD28P10747 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CD28P10747 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
CD28P10747 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CD28P10747 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CD28P10747 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
CD28P10747 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
CD28P10747 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CD28P10747 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CD28P10747 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
CD28P10747 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CD28P10747 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CD28P10747 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CD28P10747 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CD28P10747 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CD28P10747 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CD28P10747 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CD28P10747 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CD28P10747 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CD28P10747 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CD28P10747 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CD28P10747 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CD28P10747 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CD28P10747 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CD28P10747 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms