Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALUO43852 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALUO43852 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALUO43852 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALUO43852 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALUO43852 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALUO43852 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CALUO43852 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALUO43852 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALUO43852 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALUO43852 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALUO43852 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CALUO43852 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALUO43852 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CALUO43852 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALUO43852 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALUO43852 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALUO43852 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALUO43852 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALUO43852 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CALUO43852 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALUO43852 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALUO43852 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALUO43852 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALUO43852 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CALUO43852 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALUO43852 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALUO43852 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALUO43852 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALUO43852 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALUO43852 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALUO43852 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALUO43852 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALUO43852 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALUO43852 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALUO43852 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALUO43852 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALUO43852 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALUO43852 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CALUO43852 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALUO43852 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALUO43852 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALUO43852 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALUO43852 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALUO43852 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALUO43852 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALUO43852 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALUO43852 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALUO43852 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALUO43852 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALUO43852 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALUO43852 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALUO43852 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALUO43852 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALUO43852 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CALUO43852 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CALUO43852 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALUO43852 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALUO43852 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALUO43852 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CALUO43852 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALUO43852 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALUO43852 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALUO43852 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALUO43852 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALUO43852 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALUO43852 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALUO43852 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALUO43852 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALUO43852 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALUO43852 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALUO43852 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALUO43852 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALUO43852 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALUO43852 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALUO43852 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALUO43852 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALUO43852 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALUO43852 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CALUO43852 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALUO43852 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALUO43852 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALUO43852 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALUO43852 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALUO43852 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALUO43852 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALUO43852 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALUO43852 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALUO43852 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALUO43852 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALUO43852 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALUO43852 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALUO43852 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALUO43852 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALUO43852 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALUO43852 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALUO43852 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALUO43852 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALUO43852 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CALUO43852 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms