Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 AL137077.2-201ENST00000635124 1608 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 AC015691.1-201ENST00000394793 535 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
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PTPRTO14522 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 AL513165.2-203ENST00000537239 717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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