Protein–RNA interactions for Protein: O00488

ZNF593, Zinc finger protein 593, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF593O00488 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF593O00488 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms